構(gòu)建有潛在高親和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-變形桿菌（USCα）的基因
文章來源：撰稿/供圖：王越 | 發(fā)布時(shí)間：2020-01-16 | 【打印】 【關(guān)閉】
近日，地外海洋系統(tǒng)研究室與普林斯頓大學(xué)地球科學(xué)系Tullis C. Onstott教授研究團(tuán)隊(duì)合作在國(guó)際期刊《Microbiology Resource Announcements》上發(fā)表了題為“Metagenome-Assembled Genome of USCα AHI, a Potential High-Affinity Methanotroph from Axel Heiberg Island, Canadian High Arctic”的論文。深海所劉翠艷研究員為通訊作者。
該研究團(tuán)隊(duì)在2011-2013年期間在加拿大北極高地海伯格島（Axel Heiberg Island；AHI）檢測(cè)到含低碳的凍土夏季時(shí)分是甲烷匯，并在2015-2016年報(bào)道了AHI融凍層含活躍的微生物，負(fù)責(zé)氧化空氣中低甲烷濃度的微生物豐度非常低（~1%）。不過，這些高親和力的甲烷氧化菌未被培養(yǎng)和分離。
本研究從21個(gè)融凍層的實(shí)驗(yàn)樣品提取的宏基因組數(shù)據(jù)，通過拼接手法，構(gòu)建了有潛在高親和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-變形桿菌（USCα）的基因組，從而揭示其生理和生長(zhǎng)需要。
拜葉林克氏菌科甲烷氧化菌與USCα AHI的基因組比較（Rusley et al.,2019）
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