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深海科學(xué)與工程研究所
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2022

FISH-TAMB,一種無(wú)需固定細(xì)胞的mRNA 熒光標(biāo)記技術(shù)

文章來(lái)源:供稿/供圖:劉翠艷  |  發(fā)布時(shí)間:2022-01-18  |  【打印】 【關(guān)閉

  

  近期地外海洋系統(tǒng)研究室劉翠艷研究員作為共同通訊作者在微生物生態(tài)學(xué)期刊Microbial Ecology上在線(xiàn)發(fā)表論文一篇,題為 FISH-TAMB, a Fixation-Free mRNA Fluorescent Labeling Technique to Target Transcriptionally Active Members in Microbial Communities。研究人員開(kāi)發(fā)了一種適用于標(biāo)記古菌和細(xì)菌的信使RNA(mRNA)的熒光原位雜交(FISH)技術(shù)。FISH-TAMB 方法與現(xiàn)有 FISH 方法的不同之處在于緩沖液中不含固定劑或表面活性劑,在目標(biāo)細(xì)胞的生長(zhǎng)溫度下雜交時(shí)間短至 15 分鐘,并且省略了洗滌步驟。論文詳細(xì)地介紹了 FISH-TAMB 的制備和應(yīng)用例子。通過(guò)對(duì)(1) 表達(dá)產(chǎn)甲烷菌 Methanosarcina barkeri mcrA基因的大腸桿菌; (2) M. barkeri;和(3) 來(lái)自深部大陸鉆孔的厭氧甲烷營(yíng)養(yǎng) (ANME) 富集培養(yǎng),證明了FISH-TAMB 標(biāo)記細(xì)胞內(nèi) mRNA 靶標(biāo)、區(qū)分轉(zhuǎn)錄狀態(tài)、檢測(cè)活躍和稀有分類(lèi)群以及保持細(xì)胞活力的能力。FISH-TAMB 具有多復(fù)用和可應(yīng)用于16S rRNA的潛力,在環(huán)境微生物學(xué)領(lǐng)域具有潛在的廣泛應(yīng)用。 

 

    

FISH-TAMB探針構(gòu)象及與信使RNA雜交過(guò)程(Harris, Lau et al. 2021) 

    

  原文鏈接: 

  https://link.springer.com/article/10.1007/s00248-021-01809-5 

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